動物健康養殖重點學科成立于2007年9月，主要從事動物健康養殖基礎理論研究和應用技術的推廣，旨在促進我國養殖業的健康持續發展，從源頭上解決動物食品安全問題，爲我國和上海的畜牧業健康持續發展提供技術支撐。學科設四個研究方向：動物種質資源的保護和開發、動物健康營養調控、動物健康與生態環境控制、畜禽養殖疾病預警與防控。動物健康養殖學科設首席科學家1人，學科帶頭人4人，具有博士學位的科技人員8人，科技人員共20 人。